Moždani udar je iznenadni gubitak moždane funkcije uzrokovan poremećajem opskrbe krvlju. Vodeći je uzrok onesposobljenosti, drugi vodeći uzrok smrti u svijetu te prvi uzrok invalidnosti u Hrvatskoj. Moždani udar kao naglo nastali poremećaj moždane cirkulacije iziskuje hitnu medicinsku pomoć. U dijagnostici moždanog udara se najčešće koriste radiološke metode i EEG, no zbog nejasnog nalaza kod 5-10% slučajeva se uz radiološke pretrage rade i pretrage likvora. Najčešće pretrage koje se rade u likvoru u dijagnostici moždanog udara su: izgled i boja likvora, spektrofotometrijska analiza hematogenih pigmenata, citološka analiza, te osnovne biokemijske pretrage likvora. Velik predanalitički problem kod pretraga likvora u moždanom udaru je traumatska punkcija. Za ispravno razlikovanje intracerebralne hemoragije od traumatske punkcije likvor treba skupljati u više epruveta (najčešće tri) koje trebaju biti dobro označene. Citološku analizu likvora treba napraviti u svim uzorcima. Spektrofotometrijska analiza hematogenih pigmenata u likvoru je najpouzdanija pretraga likvora koja se rutinski radi u diferencijalnoj dijagnostici moždanog udara. Ovom metodom se u likvoru pacijenata s moždanim udarom mogu dokazati i vrlo male količine prisutnih hematogenih pigmenata (oksihemoglobina, bilirubina i methemoglobina). Istraživanja su usmjerena ka pronalaženju novih, osjetljivijih biljega koji bi omogućili pouzdaniju dijagnostiku moždanog udara u ranoj fazi bolesti. Noviji biljezi koji se određuju u likvoru, a koriste se za rano postavljanje dijagnoze, praćenje i prognozu ishoda kod moždanog udara su protein S100 i feritin.