Potencijalni biokemijski biljezi izgradnje i razgradnje kostiju općenito se dijele na 1) enzimske biljege izgradnje i razgradnje, 2) proteine koštanog matriksa i razgradne produkte organskog skeletnog matriksa koji su mjera izgradnje i razgradnje kostiju te 3) biljege anorganskog koštanog matriksa Ca i P. Kost je u stalnom procesu trošenja i obnavljanja pa je upravo zbog praćenja ravnoteže tih procesa potrebno imati kontrolne biljege izgradnje i razgradnje kosti. Najpoznatija bolest koštanog tkiva je osteoporoza, koja upravo nastaje zbog manje kvalitete kostiju, a posljedica je poremećaja ravnoteže u procesu koštane pregradnje. Ukupna alkalna fosfataza, kao i njeni izoenzimi, dobar su pokazatelj aktivnosti osteoblasta i formiranja kosti, tj. procesa izgradnje kostiju. Uz ukupnu alkalnu fosfatazu, određivanje aktivnosti koštanog izoenzima alkalne fosfataze ima posebnu važnost kod praćenja terapije osteoporoze jer je on najviše zastupljen među ostalim izoenzimima alkalne fosfataze (jetreni, crijevni). Koštani izoenzim alkalne fosfataze direktna je mjera aktivnosti osteoblasta. Njegovo izlučivanje ne ovisi o bubrežnoj funkciji, ima manju biološku varijaciju od ostalih biljega što ga čini dobrim biljegom praćenja uspješnosti terapije osteoporoze.