Lipoproteini predstavljaju čestice sastavljene od lipida i proteina i nalazimo ih u krvnoj plazmi. Po kemijskom sastavu lipoproteini su srodni staničnim membranama te su prenositelji lipida do svih stanica organizma. Prema njihovoj različitoj elektroforetskoj pokretljivosti dijele se na: alfa, pre-beta i beta- lipoproteine te kilomikrone. Uvođenjem homogenih imunokemijskih metoda, koje su potpuno automatizirane, omogućeno je enzimsko određivanje kolesterola, triglicerida i HDLkol, a LDL-kol se izračunava Friedwaldovom jednadžbom kod koncentracije triglicerida < 4,0 mmol/L. Kod vrijednosti triglicerida viših od 4,0 mmol/L primjenjuju se direktne metode za određivanje LDL-kol enzimskom reakcijom. Zbog navedenih metoda izgubila se potreba za elektroforetskim razdvajanjem lipoproteina na agarozi uz posebne uvjete za razdvajanje lipida i bojenje sa Sudan black bojom. Međutim, pojavom kapilarne zonske elektroforeze, zbog njene visoke rezolucijske moći, razdvajanje lipoproteina se događa istovremeno uz iste uvjete kao i ostale frakcije proteina u serumu. Tako ćemo uz elektroforezu proteina u serumu moći uočiti i eventualnu prisutnost povišenih vrijednosti apolipoproteina A, B i C.