Seksualna disfunkcija općenit je pojam koji uključuje veliki broj različitih seksualnih problema s kojima se žene i muškarci mogu susresti. Definicija seksualne disfunkcije široka je i postoji mnogo različitih čimbenika koji mogu utjecati na seksualnu funkciju. Ključni čimbenici koji imaju neposredan utjecaj na seksualnu funkciju su oni emocionalni, hormonalni, fizički i psihološki čimbenici. Za muškarce i žene fizioterapijska intervencija u kontekstu seksualnog zdravlja zauzima holistički pristup i uključuje liječenje mišića dna zdjelice koji podržavaju kralježnicu, zdjelicu i unutarnje organe. Žene s vulvarnom boli, dispareunijom ili vaginizmom imaju ograničenu sposobnost seksualnog funkcioniranja koje se utvrđuje s mišićno-koštanim i neurološkim nalazima sukladno kojima postupa obučeni fizioterapeut. Fizioterapeuti igraju važnu ulogu u olakšavanju optimalne seksualne funkcije pružanjem tretmana za vraćanje funkcije, poboljšanja pokretljivosti i ublažavanja boli. Kod muškaraca je učestalo prisutna erektilna disfunkcija kao i problemi vezani uz prijevremenu ejakulaciju. Fizioterapeuti prvenstveno procjenjuju mišiće dna zdjelice (snagu, raspon pokreta, uključujući fazu kontrakcije i otpuštanja). Oni također procjenjuju mišiće oko zdjelice (iznutra i izvana) i vrše mjerenja i procjenjuju funkcionalnu kontrolu zdjeličnog dna. Postoje razne skale i upitnici utvrđivanja seksualne disfunkcije. Na temelju procjene fizioterapeut prilagođava specifične programe vježbi i tretmana. Intervencije liječenja mogu uključivati uporabu ručne terapije, edukacije, vježbe jačanja mišića zdjeličnog dna, propisivanja istih i elektro-fizičke opreme. Fizioterapijska intervencija kod muškaraca sa seksualnom disfunkcijom koristi se kod erektilne disfunkcije i prijevremene ejakulacije. Fizioterapijske intervencije uključuju vježbe mišića dna zdjelice, Kegelove vježbe, elektrostimulaciju, biofeedback, shockwave terapiju niskog intenziteta, vježbe disanja, aerobne vježbe, edukacije za vježbe kod kuće te također, linearnu metodu udarnim valovima, squeeze metodu i stop-start metodu.